Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL23P62829 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL23P62829 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPL23P62829 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL23P62829 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL23P62829 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms