Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms