Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA1P59665 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA1P59665 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms