Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP107P57740 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP107P57740 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP107P57740 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP107P57740 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP107P57740 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP107P57740 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP107P57740 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP107P57740 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP107P57740 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP107P57740 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP107P57740 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP107P57740 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP107P57740 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP107P57740 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP107P57740 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP107P57740 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP107P57740 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP107P57740 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms