Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRIM1P49642 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms