Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFMP43652 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFMP43652 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFMP43652 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFMP43652 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFMP43652 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFMP43652 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFMP43652 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFMP43652 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFMP43652 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFMP43652 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFMP43652 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFMP43652 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AFMP43652 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFMP43652 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AFMP43652 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFMP43652 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFMP43652 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFMP43652 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFMP43652 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFMP43652 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFMP43652 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFMP43652 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFMP43652 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFMP43652 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFMP43652 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFMP43652 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFMP43652 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFMP43652 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFMP43652 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFMP43652 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFMP43652 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFMP43652 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFMP43652 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFMP43652 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFMP43652 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFMP43652 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFMP43652 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFMP43652 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms