Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPD2P43304 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPD2P43304 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPD2P43304 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
GPD2P43304 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPD2P43304 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPD2P43304 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPD2P43304 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPD2P43304 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPD2P43304 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPD2P43304 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPD2P43304 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPD2P43304 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPD2P43304 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPD2P43304 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPD2P43304 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPD2P43304 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPD2P43304 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPD2P43304 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPD2P43304 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPD2P43304 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPD2P43304 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPD2P43304 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPD2P43304 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPD2P43304 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPD2P43304 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPD2P43304 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPD2P43304 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPD2P43304 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPD2P43304 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPD2P43304 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPD2P43304 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPD2P43304 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPD2P43304 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPD2P43304 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPD2P43304 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPD2P43304 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPD2P43304 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPD2P43304 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPD2P43304 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPD2P43304 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPD2P43304 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPD2P43304 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPD2P43304 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPD2P43304 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPD2P43304 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPD2P43304 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPD2P43304 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPD2P43304 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPD2P43304 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPD2P43304 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPD2P43304 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPD2P43304 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPD2P43304 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPD2P43304 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPD2P43304 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPD2P43304 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPD2P43304 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms