Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL4P36578 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL4P36578 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL4P36578 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL4P36578 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL4P36578 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL4P36578 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL4P36578 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL4P36578 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL4P36578 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL4P36578 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL4P36578 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL4P36578 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL4P36578 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL4P36578 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL4P36578 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL4P36578 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL4P36578 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL4P36578 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL4P36578 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL4P36578 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL4P36578 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL4P36578 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL4P36578 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL4P36578 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL4P36578 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL4P36578 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL4P36578 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL4P36578 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL4P36578 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL4P36578 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL4P36578 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL4P36578 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL4P36578 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms