Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCK1P35558 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCK1P35558 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCK1P35558 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCK1P35558 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK1P35558 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK1P35558 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK1P35558 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK1P35558 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK1P35558 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK1P35558 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK1P35558 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK1P35558 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK1P35558 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK1P35558 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK1P35558 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK1P35558 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK1P35558 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK1P35558 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK1P35558 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK1P35558 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK1P35558 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCK1P35558 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCK1P35558 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCK1P35558 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCK1P35558 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCK1P35558 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCK1P35558 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCK1P35558 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms