Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.58■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms