Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM3P06753 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM3P06753 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM3P06753 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM3P06753 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM3P06753 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM3P06753 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM3P06753 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM3P06753 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM3P06753 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM3P06753 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM3P06753 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM3P06753 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM3P06753 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM3P06753 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM3P06753 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM3P06753 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM3P06753 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM3P06753 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM3P06753 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM3P06753 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM3P06753 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM3P06753 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM3P06753 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM3P06753 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM3P06753 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM3P06753 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM3P06753 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM3P06753 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM3P06753 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM3P06753 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM3P06753 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM3P06753 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM3P06753 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM3P06753 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM3P06753 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM3P06753 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM3P06753 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM3P06753 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM3P06753 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM3P06753 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM3P06753 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM3P06753 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM3P06753 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM3P06753 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms