Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOA4P06727 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOA4P06727 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOA4P06727 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOA4P06727 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOA4P06727 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOA4P06727 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOA4P06727 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOA4P06727 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA4P06727 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA4P06727 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA4P06727 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA4P06727 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA4P06727 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA4P06727 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA4P06727 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA4P06727 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOA4P06727 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms