Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms