Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A1O14983 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A1O14983 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2A1O14983 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A1O14983 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A1O14983 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms