Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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