Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms