Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms