Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A6NNZ2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A6NNZ2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A6NNZ2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NNZ2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NNZ2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A6NNZ2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms