Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM223BA6NKX1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms