Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms