Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms