Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME2A4GXA9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EME2A4GXA9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EME2A4GXA9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME2A4GXA9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME2A4GXA9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME2A4GXA9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME2A4GXA9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME2A4GXA9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME2A4GXA9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME2A4GXA9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME2A4GXA9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms