Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms