Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms