Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CIT-214ENST00000544588 594 ntTSL 414.07□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 AC005154.1-224ENST00000582733 521 ntTSL 414.04□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ESPL1-202ENST00000535123 1203 ntTSL 213.97□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC26A6-222ENST00000496469 1034 ntTSL 513.94□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-218ENST00000592632 586 ntTSL 213.9□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DENND5A-214ENST00000531747 915 ntTSL 313.85□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ASAP3-208ENST00000492982 3024 ntTSL 213.8□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STK40-206ENST00000460417 681 ntTSL 213.79□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.217e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FIP1L1-210ENST00000511376 582 ntTSL 513.76□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-217ENST00000580331 558 ntTSL 413.52□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 TSPAN13-202ENST00000466195 568 ntTSL 413.51□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PPP2R1A-207ENST00000473455 615 ntTSL 313.41□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DNAJB14-212ENST00000610281 339 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SUPT6H-209ENST00000583972 1969 ntTSL 213.11□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 RBM8A-202ENST00000484825 542 ntTSL 513.07□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SCFD1-201ENST00000311943 2016 ntTSL 213.06□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-211ENST00000433016 855 ntTSL 512.97□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-219ENST00000466166 545 ntTSL 412.97□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CSNK1E-213ENST00000495232 669 ntTSL 212.95□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 RBM8A-209ENST00000634161 464 ntTSL 312.8□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FNTA-209ENST00000531266 590 ntTSL 512.74□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PCNA-201ENST00000379143 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.377e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 RBM8A-203ENST00000498663 764 ntTSL 212.63□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KAT5-215ENST00000534293 559 ntTSL 312.6□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FNTA-211ENST00000533368 534 ntTSL 212.46□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DTYMK-203ENST00000420144 575 ntTSL 512.43□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-223ENST00000582114 647 ntTSL 212.38□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CSNK1E-212ENST00000494610 539 ntTSL 212.34□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CREB1-206ENST00000432329 7650 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-212ENST00000440209 557 ntTSL 412.15□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 YIPF5-204ENST00000513112 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 YIPF5-202ENST00000448443 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SCFD1-206ENST00000484733 2308 ntTSL 512.08□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 LIG3-204ENST00000585740 887 ntTSL 312.06□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-225ENST00000582482 2455 ntTSL 211.87□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 G3BP2-204ENST00000499709 508 ntTSL 411.78□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DENND5A-208ENST00000528725 728 ntTSL 311.66□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 EPC2-203ENST00000409654 1624 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DENND5A-203ENST00000525784 782 ntTSL 311.56□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 AC005154.1-221ENST00000581794 2795 ntTSL 211.53□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FAM192A-220ENST00000569266 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ASAP3-209ENST00000495646 2552 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STK40-207ENST00000473733 629 ntTSL 311.12□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 GPSM3-210ENST00000619085 1177 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 AC005154.1-223ENST00000584372 547 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SCFD1-220ENST00000556486 974 ntTSL 211□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DENND5A-209ENST00000529977 2606 ntTSL 210.92□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 NFATC2IP-203ENST00000564978 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.667e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-213ENST00000444960 783 ntTSL 410.88□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FAM192A-202ENST00000389447 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 YIPF5-206ENST00000522203 653 ntTSL 510.52□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-220ENST00000593008 538 ntTSL 310.48□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CLPTM1L-204ENST00000503534 742 ntTSL 210.33□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SRSF4-205ENST00000497015 516 ntTSL 210.19□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FAM192A-213ENST00000566403 1396 ntTSL 510.18□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-207ENST00000422347 483 ntTSL 59.99□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-209ENST00000425919 572 ntTSL 59.99□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 UBAC1-205ENST00000486258 243 ntTSL 39.93□□□□□ -0.827e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-206ENST00000413688 551 ntTSL 49.92□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-216ENST00000454017 978 ntTSL 39.92□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ARHGDIA-210ENST00000582520 245 ntTSL 39.86□□□□□ -0.837e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DNAJB14-211ENST00000493110 408 ntTSL 59.79□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-208ENST00000425073 546 ntTSL 49.61□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 INTS3-209ENST00000503133 1896 ntTSL 29.54□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 G3BP2-209ENST00000507701 678 ntTSL 29.54□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SCFD1-211ENST00000554437 688 ntTSL 39.49□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 AC005154.1-226ENST00000584023 638 ntTSL 39.48□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KIAA0100-216ENST00000583860 432 ntTSL 29.25□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF131-204ENST00000503599 750 ntTSL 39.24□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-229ENST00000583697 852 ntTSL 39.2□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 HSDL2-203ENST00000467434 878 ntTSL 59.09□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 IFT122-216ENST00000508654 565 ntTSL 49.08□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DAXX-208ENST00000477162 847 ntTSL 59.05□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 AGTRAP-207ENST00000471765 717 ntTSL 38.86□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -13e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CREB1-212ENST00000455757 730 ntTSL 38.66□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 COCH-207ENST00000553833 635 ntTSL 58.63□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 COCH-211ENST00000557065 654 ntTSL 58.61□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DNAJB14-209ENST00000471738 561 ntTSL 28.59□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FAM192A-211ENST00000565956 618 ntTSL 38.5□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CBFA2T2-208ENST00000491618 865 ntTSL 58.47□□□□□ -1.057e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PIK3C3-211ENST00000589550 597 ntTSL 38.33□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SZRD1-208ENST00000476423 567 ntTSL 48.23□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 YTHDF2-204ENST00000475796 358 ntTSL 28.2□□□□□ -1.17e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FNTA-213ENST00000533559 429 ntTSL 38.17□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-218ENST00000458493 507 ntTSL 48.11□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CREB1-203ENST00000418081 893 ntTSL 58.08□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 28.8
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4118.8 ms