Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 GTPBP2-206ENST00000452781 681 ntTSL 521.32■■□□□ 13e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-211ENST00000440422 659 ntTSL 524.63■■□□□ 1.533e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-213ENST00000444183 526 ntTSL 514.35□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-217ENST00000453281 534 ntTSL 214.35□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-220ENST00000466012 572 ntTSL 513.17□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-223ENST00000495113 596 ntTSL 213.02□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-209ENST00000437694 992 ntTSL 211.44□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-215ENST00000445635 1251 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF692-211ENST00000477070 1521 ntTSL 522.43■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF692-227ENST00000533927 2026 ntTSL 1 (best)19.34■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF692-210ENST00000476503 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.71■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF692-216ENST00000491971 805 ntTSL 213.4□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF692-209ENST00000474351 867 ntTSL 211.31□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 CALR-206ENST00000588454 776 ntTSL 311.7□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.265e-8■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.935e-8■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 ILKAP-207ENST00000467133 618 ntTSL 420.54■□□□□ 0.885e-8■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 ILKAP-204ENST00000463129 1861 ntTSL 219.6■□□□□ 0.735e-8■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 ILKAP-203ENST00000457149 793 ntTSL 519.54■□□□□ 0.725e-8■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.725e-8■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 ILKAP-210ENST00000498727 587 ntTSL 219.48■□□□□ 0.715e-8■■■■■ 29.1
UTP3Q9NQZ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.983e-8■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.843e-8■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.723e-8■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-8■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-8■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.376e-8■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 CTTN-206ENST00000482755 1087 ntTSL 220.65■□□□□ 0.98e-8■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.478e-8■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 DHX15-206ENST00000510645 470 ntTSL 510.84□□□□□ -0.678e-8■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 PTTG1-203ENST00000517480 684 ntTSL 59.34□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 DHX15-205ENST00000508368 415 ntTSL 28.88□□□□□ -0.998e-8■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 PTTG1-204ENST00000519287 670 ntTSL 58.68□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 PTTG1-206ENST00000523659 851 ntTSL 28.68□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 PTTG1-207ENST00000524244 434 ntTSL 28.06□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 DHX15-208ENST00000512903 2071 ntTSL 27.33□□□□□ -1.248e-8■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 DHX15-209ENST00000513036 1848 ntTSL 27.08□□□□□ -1.288e-8■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.928e-7■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 CLINT1-210ENST00000530742 3344 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.298e-7■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 RAD21-209ENST00000523547 908 ntTSL 324.04■■□□□ 1.445e-9■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 RAD21-208ENST00000522699 548 ntTSL 318.03■□□□□ 0.485e-9■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 RAD21-202ENST00000517485 874 ntTSL 315.96■□□□□ 0.155e-9■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 RAD21-205ENST00000519469 549 ntTSL 211.06□□□□□ -0.645e-9■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 RAD21-206ENST00000519837 515 ntTSL 410.91□□□□□ -0.665e-9■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 RAD21-207ENST00000520992 831 ntTSL 48.77□□□□□ -1.015e-9■■■■■ 29
UTP3Q9NQZ2 SLC6A8-209ENST00000476466 470 ntTSL 315.09■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 28.9
UTP3Q9NQZ2 DDX5-224ENST00000583239 474 ntTSL 412.32□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 28.9
UTP3Q9NQZ2 DDX5-206ENST00000578190 582 ntTSL 38.13□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 28.9
UTP3Q9NQZ2 DDX5-211ENST00000579091 531 ntTSL 48.01□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 28.9
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 28.9
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-225ENST00000622850 1987 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 28.9
UTP3Q9NQZ2 RUNDC1-203ENST00000590836 1439 nt28.58■■■□□ 2.177e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 NFATC2IP-202ENST00000562977 638 ntTSL 427.88■■■□□ 2.057e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 RUNDC1-202ENST00000589705 959 ntTSL 527.72■■■□□ 2.037e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CKB-217ENST00000557569 579 ntTSL 227.69■■■□□ 2.023e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FNTA-204ENST00000525699 516 ntTSL 527.61■■■□□ 2.013e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.013e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FNTA-214ENST00000533998 581 ntTSL 326.96■■□□□ 1.913e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.857e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.763e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35A2-216ENST00000635460 706 ntTSL 525.8■■□□□ 1.727e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.687e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.673e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 MTA1-209ENST00000469140 1666 ntTSL 525.38■■□□□ 1.653e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.613e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.587e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 HGS-209ENST00000573080 1809 nt24.7■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FNTA-202ENST00000524546 750 ntTSL 324.62■■□□□ 1.533e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FNTA-212ENST00000533383 982 ntTSL 524.62■■□□□ 1.533e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.447e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.423e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-205ENST00000586993 585 ntTSL 423.82■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 323.18■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-215ENST00000590696 563 ntTSL 423.02■■□□□ 1.283e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35A2-215ENST00000635285 2046 ntTSL 523.01■■□□□ 1.277e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-214ENST00000578577 1511 ntTSL 222.82■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.247e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.117e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ATP1A1-208ENST00000488733 1728 ntTSL 221.68■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 MTA1-213ENST00000490198 814 ntTSL 321.56■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC39A3-206ENST00000590875 572 ntTSL 221.53■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FNTA-206ENST00000527153 582 ntTSL 321.45■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SAFB-209ENST00000591666 632 ntTSL 321.18■□□□□ 0.987e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ATP1A1-204ENST00000418797 654 ntTSL 321.01■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 28.8
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