Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PIGT-225ENST00000638689 4314 ntTSL 511.41□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 31.5
UTP3Q9NQZ2 PIGT-229ENST00000638745 6087 ntTSL 511.35□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 31.5
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.539e-7■■■■■ 31.5
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-211ENST00000480479 2792 ntTSL 213.76□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 31.5
UTP3Q9NQZ2 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 31.5
UTP3Q9NQZ2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 31.5
UTP3Q9NQZ2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 31.5
UTP3Q9NQZ2 NFE2-205ENST00000553198 1208 ntTSL 516.3■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 31.5
UTP3Q9NQZ2 SETD5-225ENST00000488236 1320 ntTSL 58.54□□□□□ -1.044e-8■■■■■ 31.5
UTP3Q9NQZ2 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 31.4
UTP3Q9NQZ2 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 31.4
UTP3Q9NQZ2 BSG-211ENST00000576984 544 ntTSL 420.41■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 31.4
UTP3Q9NQZ2 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 31.4
UTP3Q9NQZ2 PSMB2-203ENST00000630477 1127 ntTSL 1 (best)10.6□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 31.4
UTP3Q9NQZ2 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 31.4
UTP3Q9NQZ2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.221e-7■■■■■ 31.4
UTP3Q9NQZ2 DCTN1-218ENST00000466110 5414 ntTSL 215.41■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 31.4
UTP3Q9NQZ2 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 31.4
UTP3Q9NQZ2 DCTN1-204ENST00000409438 4145 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 31.4
UTP3Q9NQZ2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 31.4
UTP3Q9NQZ2 P4HB-207ENST00000472244 858 ntTSL 519.82■□□□□ 0.768e-7■■■■■ 31.3
UTP3Q9NQZ2 CAPN2-206ENST00000474026 4130 ntTSL 25.36□□□□□ -1.553e-6■■■■■ 31.3
UTP3Q9NQZ2 MAPK8IP3-207ENST00000564098 4436 ntTSL 217.27■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 31.3
UTP3Q9NQZ2 SRSF2-201ENST00000358156 572 ntTSL 419.92■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 31.2
UTP3Q9NQZ2 SRSF2-207ENST00000583836 561 ntTSL 518.64■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 31.2
UTP3Q9NQZ2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 31.2
UTP3Q9NQZ2 CTDSPL2-209ENST00000560620 863 ntTSL 313.88□□□□□ -0.191e-12■■■■■ 31.2
UTP3Q9NQZ2 CTDSPL2-211ENST00000561189 742 ntTSL 55.99□□□□□ -1.451e-12■■■■■ 31.2
UTP3Q9NQZ2 ANKRD12-208ENST00000581758 323 ntTSL 53.9□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 31.2
UTP3Q9NQZ2 CIRBP-218ENST00000588344 370 ntTSL 39.65□□□□□ -0.865e-7■■■■■ 31.2
UTP3Q9NQZ2 SQSTM1-215ENST00000514093 842 ntTSL 521.44■■□□□ 1.022e-8■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 SQSTM1-209ENST00000504627 602 ntTSL 519.06■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 SQSTM1-212ENST00000508284 578 ntTSL 419.06■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 SQSTM1-205ENST00000464493 532 ntTSL 415.54■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 SQSTM1-207ENST00000481335 562 ntTSL 412.8□□□□□ -0.362e-8■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 SQSTM1-203ENST00000422245 628 ntTSL 412.19□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 220.38■□□□□ 0.858e-7■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 CHD2-205ENST00000625662 5127 ntTSL 513.73□□□□□ -0.219e-8■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.88□□□□□ -1.312e-19■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 RMND5B-202ENST00000502814 653 ntTSL 326.41■■□□□ 1.825e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 RMND5B-207ENST00000512663 738 ntTSL 525.09■■□□□ 1.615e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.45e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 RMND5B-203ENST00000507457 808 ntTSL 222.8■■□□□ 1.245e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.25e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.155e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 SERPINH1-211ENST00000529643 660 ntTSL 322.03■■□□□ 1.125e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 TCIRG1-204ENST00000525516 708 ntTSL 221.4■■□□□ 1.025e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 STK25-229ENST00000492127 1153 ntTSL 221.32■■□□□ 15e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 TRMT2A-210ENST00000464535 943 ntTSL 221.01■□□□□ 0.955e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 C19orf48-207ENST00000596655 1639 ntTSL 220.5■□□□□ 0.875e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 ABCF3-207ENST00000468892 1360 ntTSL 320.09■□□□□ 0.815e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.765e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 RMND5B-204ENST00000507575 2092 ntTSL 219.48■□□□□ 0.715e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 SERPINH1-209ENST00000528760 773 ntTSL 219.41■□□□□ 0.75e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 SERPINH1-210ENST00000528990 587 ntTSL 319.39■□□□□ 0.695e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.675e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 PEX14-202ENST00000472851 805 ntTSL 319.24■□□□□ 0.675e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 CTSH-211ENST00000530010 556 ntTSL 219.18■□□□□ 0.665e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 UPF3A-203ENST00000474056 748 ntTSL 319.12■□□□□ 0.655e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 ABCF3-217ENST00000489719 569 ntTSL 418.98■□□□□ 0.635e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 UPF3A-206ENST00000480362 965 ntTSL 518.97■□□□□ 0.635e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.625e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 SERPINH1-214ENST00000533449 582 ntTSL 318.5■□□□□ 0.555e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 SERPINH1-204ENST00000525611 974 ntTSL 518.44■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 SERPINH1-207ENST00000526397 882 ntTSL 518.44■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.525e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 TRMT2A-219ENST00000494641 1060 ntTSL 318.19■□□□□ 0.55e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 NARS-207ENST00000587675 1002 ntTSL 217.72■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 ACAT2-202ENST00000467951 856 ntTSL 317.41■□□□□ 0.387e-11■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 RAI1-204ENST00000489697 1570 ntTSL 317.13■□□□□ 0.335e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.325e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.325e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 ABCF3-208ENST00000471226 650 ntTSL 516.18■□□□□ 0.185e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 HSPG2-214ENST00000635682 921 ntTSL 515.76■□□□□ 0.115e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 PRMT5-209ENST00000553502 414 ntTSL 315.49■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 LEMD2-213ENST00000514636 544 ntTSL 315.46■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 ABCF3-211ENST00000475728 503 ntTSL 315.37■□□□□ 0.055e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 ASB1-208ENST00000481566 701 ntTSL 515.21■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.025e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 ABCF3-209ENST00000472608 657 ntTSL 215.12■□□□□ 0.015e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 ABCF3-210ENST00000473311 2844 ntTSL 515.02■□□□□ -05e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 UPF3A-204ENST00000475218 1791 ntTSL 1 (best)15.01□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 UBE4B-206ENST00000466379 2299 ntTSL 214.77□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 C19orf48-210ENST00000598463 1844 ntTSL 1 (best)14.76□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 PIGT-227ENST00000638710 2327 ntTSL 514.61□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 PIGT-226ENST00000638691 823 ntTSL 314.37□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 PIGT-254ENST00000640123 847 ntTSL 514.37□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 C19orf48-212ENST00000600373 709 ntTSL 214.36□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 PIGT-231ENST00000638927 1457 ntTSL 514.06□□□□□ -0.165e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 NARS-202ENST00000411676 1097 ntTSL 213.93□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 NARS-206ENST00000587366 515 ntTSL 413.93□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 SERPINH1-208ENST00000526638 719 ntTSL 213.71□□□□□ -0.215e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 C19orf48-206ENST00000596554 727 ntTSL 313.7□□□□□ -0.225e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 RMND5B-206ENST00000508647 562 ntTSL 413.59□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 PIGT-270ENST00000640940 1764 ntTSL 513.32□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 PIGT-220ENST00000638537 1902 ntTSL 513.31□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 PIGT-263ENST00000640549 1437 ntTSL 513.3□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 PIGT-243ENST00000639292 1938 ntTSL 513.03□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 31.1
UTP3Q9NQZ2 UPF3A-210ENST00000493727 937 ntTSL 512.95□□□□□ -0.345e-6■■■■■ 31.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 2644.1 ms