Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA4Q9UN74 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA4Q9UN74 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms