Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms