Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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