Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms