Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms