Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKRIP1Q9H875 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms