Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms