Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms