Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INTS4Q96HW7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS4Q96HW7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms