Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAF2Q96CS3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms