Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 TRIM33-203ENST00000448034 2706 ntTSL 54.29□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM117-203ENST00000546868 2607 ntTSL 1 (best)4.27□□□□□ -1.732e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC38A9-220ENST00000513993 571 ntTSL 44.26□□□□□ -1.732e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MYO1B-211ENST00000471904 770 ntTSL 34.26□□□□□ -1.732e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.736e-8■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PTPRK-209ENST00000415046 1029 ntTSL 54.21□□□□□ -1.742e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 STX8-202ENST00000570583 367 ntTSL 54.21□□□□□ -1.742e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 WDR41-218ENST00000511630 516 ntTSL 34.17□□□□□ -1.742e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TAF1B-209ENST00000492648 1045 ntTSL 54.17□□□□□ -1.742e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 WDR41-211ENST00000507654 562 ntTSL 54.13□□□□□ -1.752e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.752e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PCMTD1-204ENST00000519975 995 ntTSL 24.04□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC38A9-211ENST00000506624 370 ntTSL 54□□□□□ -1.772e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PTPN12-202ENST00000407343 704 ntTSL 33.97□□□□□ -1.772e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZEB1-212ENST00000558655 2773 ntTSL 23.96□□□□□ -1.782e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CCDC91-221ENST00000545737 1578 ntTSL 1 (best)3.94□□□□□ -1.782e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UCHL3-202ENST00000419068 824 ntTSL 53.94□□□□□ -1.782e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.782e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CUL3-208ENST00000454323 688 ntTSL 33.88□□□□□ -1.792e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EIF3E-209ENST00000519627 697 ntTSL 23.85□□□□□ -1.792e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PPIL2-206ENST00000458567 557 ntTSL 43.82□□□□□ -1.82e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KMT5A-208ENST00000485469 454 ntTSL 33.82□□□□□ -1.82e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ALDH3A2-209ENST00000571537 607 ntTSL 23.81□□□□□ -1.82e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ALDH3A2-217ENST00000578696 400 ntTSL 33.75□□□□□ -1.812e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATRX-206ENST00000480283 10455 ntTSL 1 (best)3.7□□□□□ -1.822e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.822e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GRAMD2B-209ENST00000509882 570 ntTSL 43.66□□□□□ -1.822e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-218ENST00000487042 889 ntTSL 53.63□□□□□ -1.832e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SMYD3-211ENST00000482592 514 ntTSL 33.62□□□□□ -1.832e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CDKL4-203ENST00000419111 388 ntTSL 53.62□□□□□ -1.832e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-210ENST00000475462 560 ntTSL 43.55□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATRX-212ENST00000623706 7245 ntTSL 23.49□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TRPM7-206ENST00000560849 624 ntTSL 33.48□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.855e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 WDR44-204ENST00000371848 2844 ntTSL 1 (best)3.46□□□□□ -1.862e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-209ENST00000472047 558 ntTSL 43.46□□□□□ -1.862e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UCHL3-205ENST00000607339 506 ntTSL 23.38□□□□□ -1.872e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.882e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CWF19L2-204ENST00000532251 2383 ntTSL 1 (best)3.31□□□□□ -1.882e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.882e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 PTK2-250ENST00000523746 574 ntTSL 43.14□□□□□ -1.912e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 UCHL3-204ENST00000606347 722 ntTSL 22.19□□□□□ -2.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GPR89B-202ENST00000461786 574 ntTSL 32.16□□□□□ -2.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CEP350-206ENST00000437245 408 ntTSL 22.11□□□□□ -2.072e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 SKAP2-206ENST00000489977 679 ntTSL 51.84□□□□□ -2.112e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 PDE4D-218ENST00000509368 2809 ntTSL 1 (best)1.8□□□□□ -2.122e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 FGFR1-235ENST00000530701 276 ntTSL 1 (best)1.72□□□□□ -2.139e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EEF1AKMT2-205ENST00000495711 524 ntTSL 21.48□□□□□ -2.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.212e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PHIP-202ENST00000479165 5694 ntTSL 1 (best)1.24□□□□□ -2.212e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MSL2-204ENST00000481989 576 ntTSL 41.12□□□□□ -2.231e-6■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATRX-218ENST00000624766 580 ntTSL 20.74□□□□□ -2.292e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CCDC91-204ENST00000536154 549 ntTSL 40.73□□□□□ -2.292e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KIAA0825-201ENST00000329378 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.727e-13■■■■■ 62.6
TBRG4Q969Z0 MTND6P3-201ENST00000520612 542 ntBASIC10.06□□□□□ -0.87e-13■■■■■ 62.6
TBRG4Q969Z0 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.947e-13■■■■■ 62.6
TBRG4Q969Z0 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)22.81■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 62.6
TBRG4Q969Z0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 62.6
TBRG4Q969Z0 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)22.81■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 62.6
TBRG4Q969Z0 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)21.73■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 62.6
TBRG4Q969Z0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 62.6
TBRG4Q969Z0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 62.6
TBRG4Q969Z0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.331e-10■■■■■ 62.5
TBRG4Q969Z0 PTK7-215ENST00000487673 5282 ntTSL 215.32■□□□□ 0.041e-10■■■■■ 62.5
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TBRG4Q969Z0 PTK7-201ENST00000230418 3958 ntTSL 1 (best)14.7□□□□□ -0.061e-10■■■■■ 62.5
TBRG4Q969Z0 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.091e-10■■■■■ 62.5
TBRG4Q969Z0 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.111e-10■■■■■ 62.5
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