RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PDE4D-218ENST00000509368 CHIC1Q5VXU3 224 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-218ENST00000509368 POTEDQ86YR6 584 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-218ENST00000509368 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-218ENST00000509368 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.96
PDE4D-218ENST00000509368 MSH5O43196 834 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-218ENST00000509368 FOXD1Q16676 465 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-218ENST00000509368 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-218ENST00000509368 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PDE4D-218ENST00000509368 PLPPR3Q6T4P5 718 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-218ENST00000509368 PPP6R1Q9UPN7 881 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-218ENST00000509368 ADRA2BP18089 450 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-218ENST00000509368 DMRT2Q9Y5R5 561 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-218ENST00000509368 POTEHQ6S545 545 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-218ENST00000509368 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-218ENST00000509368 RNF39Q9H2S5 420 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-218ENST00000509368 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.02□□□□□ -1.29
PDE4D-218ENST00000509368 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-218ENST00000509368 DCAF8L1A6NGE4 600 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-218ENST00000509368 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-218ENST00000509368 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-218ENST00000509368 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-218ENST00000509368 DSG3P32926 999 aa6.46□□□□□ -1.37
PDE4D-218ENST00000509368 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa6.46□□□□□ -1.37
PDE4D-218ENST00000509368 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-218ENST00000509368 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-218ENST00000509368 APLP2Q06481 763 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-218ENST00000509368 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-218ENST00000509368 KCNA4P22459 653 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-218ENST00000509368 CAPN15O75808 1086 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-218ENST00000509368 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-218ENST00000509368 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-218ENST00000509368 LHX8Q68G74 356 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-218ENST00000509368 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-218ENST00000509368 HAX1O00165 279 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-218ENST00000509368 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-218ENST00000509368 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-218ENST00000509368 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-218ENST00000509368 AKT1S1Q96B36 256 aa6.07□□□□□ -1.44
PDE4D-218ENST00000509368 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-218ENST00000509368 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-218ENST00000509368 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-218ENST00000509368 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-218ENST00000509368 EHMT2Q96KQ7 1210 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-218ENST00000509368 TRHP20396 242 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-218ENST00000509368 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-218ENST00000509368 ABCB7O75027 752 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-218ENST00000509368 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-218ENST00000509368 CLCN6P51797 869 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB22O15209 634 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-218ENST00000509368 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-218ENST00000509368 CSRNP3Q8WYN3 585 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-218ENST00000509368 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-218ENST00000509368 GABBR2O75899 941 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-218ENST00000509368 C19orf67A6NJJ6 358 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-218ENST00000509368 SLC4A2P04920 1241 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-218ENST00000509368 POTEMA6NI47 508 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-218ENST00000509368 EVX2Q03828 476 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-218ENST00000509368 PITPNM1O00562 1244 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-218ENST00000509368 POTEGQ6S5H5 508 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-218ENST00000509368 FOXD4L1Q9NU39 408 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-218ENST00000509368 POLA2Q14181 598 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-218ENST00000509368 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-218ENST00000509368 MAMSTRQ6ZN01 415 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-218ENST00000509368 DCBLD2Q96PD2 775 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-218ENST00000509368 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-218ENST00000509368 POTEIP0CG38 1075 aa5.57□□□□□ -1.52
PDE4D-218ENST00000509368 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PDE4D-218ENST00000509368 OTUD5Q96G74 571 aa5.55□□□□□ -1.52
PDE4D-218ENST00000509368 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PDE4D-218ENST00000509368 SPDYE2BA6NHP3 402 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-218ENST00000509368 SPDYE6P0CI01 402 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-218ENST00000509368 SPDYE2Q495Y8 402 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-218ENST00000509368 OSCARQ8IYS5 282 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-218ENST00000509368 CD44P16070 742 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PDE4D-218ENST00000509368 CDAN1Q8IWY9 1227 aa5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-218ENST00000509368 ATXN8OSP0DMR3 200 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-218ENST00000509368 SCUBE2Q9NQ36 999 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-218ENST00000509368 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-218ENST00000509368 CLEC11AQ9Y240 323 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-218ENST00000509368 MMRN1Q13201 1228 aa5.34□□□□□ -1.55
PDE4D-218ENST00000509368 SLC39A7Q92504 469 aa5.33□□□□□ -1.56
PDE4D-218ENST00000509368 C7P10643 843 aa5.33□□□□□ -1.56
PDE4D-218ENST00000509368 SLC24A1O60721 1099 aa5.33□□□□□ -1.56
PDE4D-218ENST00000509368 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-218ENST00000509368 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-218ENST00000509368 PRR29P0C7W0 189 aa5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-218ENST00000509368 POTEB2H3BUK9 544 aa5.29□□□□□ -1.56
PDE4D-218ENST00000509368 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PDE4D-218ENST00000509368 FBLN2P98095 1184 aa5.28□□□□□ -1.56
PDE4D-218ENST00000509368 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PDE4D-218ENST00000509368 SPNS2Q8IVW8 549 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-218ENST00000509368 FKBP8Q14318 412 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-218ENST00000509368 ZRANB1Q9UGI0 708 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-218ENST00000509368 CHADLQ6NUI6 762 aa5.23□□□□□ -1.57
PDE4D-218ENST00000509368 SSUH2Q9Y2M2 353 aa5.23□□□□□ -1.57
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