Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRF1Q92994 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms