Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SELENOMQ8WWX9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOMQ8WWX9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms