Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 248.2 ms