Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI47

KCTD18, BTB/POZ domain-containing protein KCTD18, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD18Q6PI47 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCTD18Q6PI47 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms