Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFXN4Q6P4A7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms