Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms