Protein–RNA interactions for Protein: Q6AWC8

Putative uncharacterized protein LOC100129027, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6AWC8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6AWC8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6AWC8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6AWC8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6AWC8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6AWC8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6AWC8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6AWC8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6AWC8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6AWC8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6AWC8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6AWC8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6AWC8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6AWC8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6AWC8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6AWC8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6AWC8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms