Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLX4IPQ5VYV7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLX4IPQ5VYV7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms