Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms