Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMP3Q1A5X7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHAMMP3Q1A5X7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms