Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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